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  1. 科学家设计病毒进化的“景观陷阱”:用新方法锁定新冠病毒逃逸路径

    病毒变异导致疫苗失效是当前公共卫生面临的重大挑战。传统疫苗可能因病毒突变而失去效力,而科学家们正在探索如何主动控制病毒的进化方向。一项发表在《美国国家科学院院刊》上的研究提出了一种名为“适应性景观设计”(FLD)的新方法,旨在通过定制病毒进化的“适应度景观”,使其无法逃逸。研究团队通过随机优化化学推导的生物物理适应度模型,成功设计出抗体集合,能够抑制新冠病毒两种基因型中和网络的适应度,并发现预防性疫苗,在逃逸变异出现前限制其适应度轨迹。这种方法为疫苗设计提供了新思路,可能帮助开发更长效的疫苗。

    科学家通过量化重塑病毒进化的结构峰和谷,将病毒“困”在低适应度区域。研究团队使用算法优化抗体,使目标蛋白(如新冠病毒)的进化路径被引导至预设的“陷阱”,从而降低其逃逸能力。具体实验中,他们成功抑制了两种SARS-CoV-2基因型中与中和抗体逃逸相关的网络,并预测了潜在的逃逸变异,提前设计疫苗以阻断这些路径。这种方法不仅验证了理论,还为实际应用提供了可能。

    这项研究的意义在于,它首次实现了对病毒进化过程的主动控制,为疫苗和药物设计开辟了新方向。然而,目前研究仍基于模拟和模型,实际应用效果需通过临床试验验证。此外,如何将这种方法扩展到其他病毒,以及长期进化中可能出现的未知变异,仍是未来需要解决的问题。这提醒我们,病毒进化并非不可预测,通过科学设计,或许能更好地应对未来的变异挑战。

    病毒进化被按住,疫苗设计更主动了🎯


    来源:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

    #病毒进化 #适应度景观 #疫苗设计 #SARSCoV2 #进化控制

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  2. 中性进化理论或将被颠覆?看似中性的分子进化,实则是适应性追踪的伪装

    我们常听说的“中性理论”认为,大多数基因突变对生物体没有影响,是“中性”的。这个理论似乎解释了为什么生物的分子层面看起来很稳定。然而,一项新研究却挑战了这一理论的核心前提。

    研究人员分析了12,267个氨基酸替换突变,发现其中超过1%是有益的。这意味着,在分子层面,超过99%的突变其实都是适应性的。但为什么我们观察到的结果却与“中性”理论一致呢?新理论“适应性追踪与拮抗性多效性”给出了答案。它认为,那些看似有益的突变,其实只在特定环境下有用。当环境变化时,这些突变反而可能有害,因此很难被固定下来。正是这种“适应性追踪”——持续适应变化的环境——导致了我们看到的“中性”现象。

    这个理论不仅解释了自然种群如何适应不断变化的环境,也挑战了“非基因决定论”的常见误解。它表明,进化并非随机,而是有策略的。该理论通过群体遗传学模拟和实验得到了支持,为理解进化的速率和模式提供了新视角。

    进化玩了个“障眼法”🤫


    来源:Nature ecology & evolution

    #中性进化理论 #适应性进化 #分子进化 #拮抗性多效性 #进化生物学

    via: 热心群友

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